Bebeğin HPV ile ilk olarak karşılaştığı yer doğum kanalıdır. Doğumdan sonra yenidoğan bebek genellikle belirtisizdir. Çocuklarda enfeksiyon çoğunlukla laringeal papillomatosis veya nadir de olsa anüs ve genital bölgede siğil olarak karşımıza çıkabilmektedir. Laringeal papillomatozis 2 ila 5 yaşları arasında gelişen larinkste (boğazda) siğil ve saplı papillom gelişimi ile karakterize bir hastalıktır. Çoğunlukla HPV Tip 6 ve Tip 11 sorumludur ve 100.000 doğumda 1.4 oranında görülmektedir. Epiglot, trakea ve hatta bronşlar tutulabilir. Laringeal papillomatozis hastalığı çocukluk çağında hava yolu daralmasının ve horlamanın en sık sebeplerinden biridir.