HPV’nin oral seks ile bulaştığı bilinmektedir. Ağız kanserlerinin yüzde 25'inin, boğaz kanserlerinin ise %35'inin HPV ile bağlantılı olabileceği düşünülmektedir. Ağız içinde aynı genital mukozadaki gibi lezyonlar izlenebilir. Bu nedenle ağızda siğil saptanan hastaların HPV tedavi ve takip protokolü aynı genital siğilde olduğu gibi yapılmalıdır. Tedavisi genital siğildeki ile aynıdır. HPV tip tayini yapılmalı ve yüksek riskli HPV tespit edilirse hasta sıkı takip edilmelidir. Gerekirse aşılama protokolü eksiksiz uygulanmalıdır. Baş boyun kanserlerinin erken teşhisi ve tedavisi için hastaların, baş boyun cerrahisi konusunda deneyimli bir kulak burun boğaz uzmanı tarafından takip edilmesi gerekmektedir. Ağızda HPV virüsü taşıyan kişiler virüsü ağızdan ağıza, ağızdan genital bölgeye, ağızdan makata bulaştırabilirler.