Kanali i lindjes është vendi ku foshnja ndesh HPV për herë të parë. Një foshnje e porsalindur zakonisht është asimptomatike pas lindjes. Tek fëmijët, infeksionet shfaqen kryesisht në formën e papillomatozës laringeale ose rrallë në formën e lythave në zonën anale dhe gjenitale. Papillomatoza laringeale është një sëmundje e karakterizuar nga formimi i lythave dhe papillomave të mbështjella në laring (fyt), e cila zhvillohet midis moshës 2 dhe 5 vjeç. Kryesisht HPV Tipi 6 dhe Tipi 11 janë përgjegjës për sëmundjen, e cila ka një prevalencë totale prej 1.4 për 100000 lindje. Mund të përfshijë epiglotisin, traken dhe madje edhe bronkët. Papillomatoza laringeale është një nga shkaqet më të zakonshme të pengesave të rrugëve të frymëmarrjes dhe gërhitjes në fëmijëri.